Als die Überreste eines mit einem neuartigen Virus infizierten Delfins in einem kalifornischen Aquarium versehentlich an die anderen Meeresbewohner verfüttert werden, dauert es nicht lange, bis sich die Krankheit auch über sie her macht – darunter gefährliche Mako-Haie und Riesenkraken. Das Virus sorgt für Mutationen und lassen auch Seelöwen, Riesenkrabben und sogar ein Krokodil sowie ein Walross mit riesigen Stoßzähnen aggressiv werden. Und ehe sich die Security-Beuaftragte Clu und die Mitarbeiter der Anlage versehen, machen sogar die Seesterne Jagd auf sie – um sich an ihren Peinigern zu rächen, die sie gefangen halten.